초음파를 이용하여 갑상선의 형태와 주변 조직과의 관계를 알아보는 방법으로 갑상선의 모양, 크기, 결절의 성상을 관찰하는데 가장 많이 이용됩니다. 세포검사를 할 때도 초음파 유도 하에 시행하면 정확한 검사부위를 찾는데 도움이 됩니다. 또한, 초음파 검사는 임신 및 수유 중인 부인에게도 해가 없으므로 안전하게 시행할 수 있습니다.

갑상선 총조직검사는 세침흡인검사보다 굵고 긴 바늘을 사용하여 갑상선 조직을 더 많이 채취할 수 있으므로 검사와 진단의 정확성을 높이고 재검사 및 오진의 비율을 줄일 수 있습니다.